В Красную книгу Российской Федерации внесено 44 вида растений и грибов, среди которых асфоделина крымская, оносма многолистная, шафран крымский, стевениелла сатириовидная, ятрышник бледный, красавка белладонна и др. В региональную Красную книгу Республики Крым внесено 152 вида растений и грибов, такие как береза повислая, железница сирийская, ландыш майский, пион крымский, аконит противоядный, мухомор цезаря, рыжик кроваво-красный и другие.
Сохранить бесценные природные сокровища горного Крыма, уникальные и эталонные участки и объекты – одна из главных задач национального парка «Крымский».